След като д-р Даниел Джаксън успява да намери адреса на изгубения град на древните. Командването на програма Старгейт събира международна експедиция за изследване от военни и цивилни, водена от д-р Елизабет Уиър, които отпътуват към галактиката Пегас в търсене на изгубения град Атлантида, изоставен от могъщата раса. Изглежда, че може да лесно да отидат в галактиката Пегас и съживят града на древните? Но там не минава всичко без проблеми: оказа се, че в тази галактика също съществуват раси, които могат да унищожат както Земята така и другите светове в Млечния път, наричани Призраци и Репликатори.
