在警界被称为“第3个S”的警察厅特殊急袭搜查组（NPS），是继特殊急袭部队（SIT）和特殊搜查班（SAT）之后的第三支警察特殊部队。NPS兼具SAT的机动性和SIT的搜查权，其与两者最大的区别就是在平息各种骚乱和暴恐活动的同时，以“逮捕”为目标，最大限度确保犯罪嫌疑人的生命安全。 NPS诞生之初，曾遭到SIT以及警界部分要员的反对，但是在队长香椎秀树（大森南朋 饰）的高效指挥下，该部队一次次出色完成任务，逐渐确立了自己在警界不可撼动的重要位置。希望凭借双手保护所有人的热血警察神御藏一号（向井理 饰）以及曾经贵为SIT头号狙击手的苏我伊织（绫野刚 饰）先后加入NPS，性格截然不同且理念根本相违的二人在接二连三的战斗中不断成长起来，并培养出生死与共的信赖和默契。 在三支精英部队的守护下，日本民众安享太平，乐而忘忧。某天，东京都发生一起巴士劫持事件，神御藏和战友们接到报警后迅速赶往现场。不过与以往同类事件略有不同的是，巴士劫匪沉默不语，始终不曾提出任何要求。与此同时，行驶在太平洋上的一艘大型货轮也遭到劫持。更令人坐立不安的是，货轮上满载着足以炸毁全日本的核燃料！ 这一消息在日本高层引起轰动，政要贵胄云集首相府邸，共商对策。就在此时，一个熟悉的声音主动致电首相府，对方宣称“我赤条条来到世间，仍将赤条条离去！”在此之后，毁灭全日本的计划进入倒计时，事态空前危急。为了保卫这个国家，守护一亿两千万人的未来，NPS与宿命的对手展开了争分夺秒的搏斗…
