Дії фільму розгортаються після того, як хлопцям вдалося покинути лабіринт. Наступного ранку юнаки опиняються в зовсім іншому світі. Уся планета спорожніла, під палючим сонцем нічого не росте, людство на межі вимирання через постійні спалахи захворювань. Кожному з героїв знову відводиться певна роль і Томас вдруге стає лідером. Тереза тепер належить до іншої групи і всім героям належить пройти через перевірку на міцність своїх стосунків.
