Odvážne myšky Bernard a Bianca z poverenia Medzinárodnej myšej záchrannej organizácie zachraňujú malé dievčatko. V podzemí budovy sídli jedna nevšedná organizácia - myšia záchranná jednotka, ktorej členovia poskytujú pomoc a zachraňujú zdravie každému, kto to potrebuje. A práve tam sa dostane fľaša so správou od malého osirelého dievčatka Penny, ktoré žiada o pomoc, pretože ju uniesla Madam Medúza. Dve myšky - statočná slečna Bianca a jej plachý partner Bernard - sa rozhodnú Penny zachrániť.
