No dia do nascimento de James Kirk, o seu pai morre numa última investida contra uma nave alienígena misteriosa. Por outro lado, Spock cresceu como uma criança vulcana inadaptada, rebelde. Vinte anos depois, Spock é um dos mais prestigiados oficiais-instrutores da frota estelar, enquanto Kirk é um rebelde problemático. Inspirado pelo capitão Christopher Pike, alista-se na frota estelar e acaba envolvido em problemas ao sabotar um exame. Mas, com a ajuda do médico Leonard McCoy, consegue integrar uma missão de emergência na USS Enterprise. Uma aventura está prestes a começar.
