Leonardo, Raphael, Michaelangelo og Donatello må redde New York City fra den onde forbryder Shredder og hans assistent, Baxter Stockman. Skildpadderne skal kæmpe mod fodsoldater, mus og bander og får hjælp fra deres sensei Splinter, April O'Neil og hendes partner Casey Jones i en actionfyldt ny serie.
